
© Георги Кожухаров
От почти всички области в България има пациенти, които са доказано заразени с британския вариант на SARS-CoV-2 (вирусът, причинител на болестта COVID-19) и затова може да се смята, че по-зара̀зната мутация е навсякъде в България. Изводът е на учени от Националния център по заразни и паразитни болести (НЦЗПБ). През изминалата седмица там са изследвали 96 проби на пациенти с коронавирус, при 68 от които е доказан британският вариант.
От наличието на мутацията не следва, че заболяването ще протече по-тежко, но информацията е важна за здравните власти в контекста на разпространението на епидемията - мутиралият вариант се предава по-лесно от човек на човек.
Доказването е възможно със специфично генетично изследване, наречено целогеномно секвениране. То е важно, защото определя идентичността на вируса. Пред "Дневник" молекулярният биолог доц. Иван Иванов от НЦЗПБ обяснява защо изследването е важно и какви са трудностите.
Британският вариант е тук... поне от декември
До края на януари доказаните пациенти, заразени с британската мутация на коронавируса бяха 33. През втората седмица на февруари са изследвани 96 проби (взети по различно време от последните дни, седмици и месеци), при 70% от които (68 на брой) е установен английският вариант.
"Вече имаме пациенти с британския вариант от почти всички области в страната, така че е навсякъде. В Кюстендил, където сега е най-сериозна обстановката, доказахме пациент отпреди новата година. Имаме проба от 31 декември, която е положителна за британския вариант", казва доц. Иван Иванов.
Той уточнява, че изследваните за мутацията проби не са случайно подбрани, а напротив - търсенето на британския вариант е било целенасочено. Това означава, че за допълнителното генетично изследване са избрани проби на заразени, които са пътували до чужбина, техни контактни или специфични проби, при които не се открива S генът при изследване с PCR тест.
Положително е, че засега южноафриканската и бразилската мутация на оригиналния SARS-CoV-2 не са доказани в България. Те, както и британският вариант се свързват с по-висок вирусен товар, което може да предполага потенциал за повишена предаваемост.
Изследване на 96 проби е малко
През изминалата седмица доказано заразените с коронавирус в България са 6136 души. На този фон изследваните 96 проби за генетични особености - които дори не са взети само от този период - са малко и представляват около 1.5% от общия брой положителни проби. За сравнение, Европейската комисия препоръчва поне 5% от положителните проби да се подложат на целогеномно секвениране, за да се вадят изводи за разпространението на мутации.
"За нашия капацитет 1% е добре, но за показателност на извадката, са малко", уточнява доц. Иван Иванов. Той обяснява, че досега в Националния център по заразни и паразитни болести е правено целогеномно секвениране на 48 проби седмично, а максималният капацитет на апарата, който прави генетичното изследване, е 96 проби. За детайлното изследване са необходими и реактиви, доставките на които се бавят, обяснява молекулярният биолог. По думите му от тази седмица България ще изпраща на всеки седем дни за допълни проучвания по 200 проби до Германия, като тази възможност е предоставено безвъзмездно от Европейската комисия.
© Георги Кожухаров
Отделно в НЦЗПБ предстои да се въведе метод, с който ще се увеличи възможният капацитет за изследване на пробите, както и да се намали цената за това. Към момента целогеномното секвениране на една проба струва около 500 лв., казва доц. Иванов, което означава, че само за последните 96 проби са вложени 48 хил. лв. С въвеждането на новия метод, вероятно през март, разходът ще бъде сведен до около 100 лв. за проба.
За допълнителни възможности за целогеномно секвениране в други три лаборатории заговори преди повече от седмица и главният държавен здравен инспектор доц. Ангел Кунчев. Засега обаче не е публично известно генетичното изследване да се прави на места извън Националния център по заразни и паразитни болести, нито да има обучени хора за това. Заради високата цена на изследването доц. Кунчев заключи, че "това не е нещо, което безкрайно можем да разширяваме".
Целогеномното секвенирано е сложно
Извън високите разходи целогеномното секвениране е труден процес от научна гледна точка, който изисква висока концентрация, за да не бъде изследването провалено.
"Отнема по минимум дванайсет часа на ден, изисква се и внимание, ангажирахме колеги, които досега не са участвали, за да помагат", казва доц. Иван Иванов. По думите му помощта на колегите до голяма степен се изразява в това да наблюдават работата по подготовката на пробите преди да влязат в машината за целогеномно секвениране. Подготовката представлява пречистване от човешкия и бактериалния материал, така че да остане само вирусният.
"Накапваме различни реагенти, смесваме, разпределяме, промиваме - има най-малко 50-60 стъпки преди една проба да стигне до секвенатора. Неговата работа пък е да изследва едновременно милиарди молекули на вируса за тяхната генетична информация. Това трае до 40 часа, така че чисто техническото време на апарата е около ден и половина, а на хората преди това е три дни", обяснява молекулярният биолог.
© Георги Кожухаров
Изходната точка за изследването също е сложна
В публичното говорене на здравни експерти и власти много често се казва, че за доказване на английската мутация се изследват проби от PCR тест за коронавирус, при които не е засечен S генът. Това означава, че тестът е потвърдил наличието на вируса по някои от другите гени, които са му заложени да търси, но не е открил гена на т. нар. Spike protein или шипчест протеин. А причината да не го открива е, че заради мутацията S генът на вируса е променен и съответно тестът не го засича.
"По принцип много малко PCR тестове въобще търсят S ген, повечето търсят други N, E и ORF гените - това са по-стандартните гени. Много малко лаборатории са си купили PCR тестове, които детектират и S ген", смята доц. Иванов. За да не насочва пациентите към конкретни лаборатории, той отказва да назове известните му места, където PCR тестовете изследват и за S ген.
При другите две често коментирани в публичното пространство мутации - южноафриканска и бразилска - за заподозиране на наличието на вариантите в България, не може да се разчита на PCR тестовете. Положителното е, че с целогеномното секвениране ще може да се установи каквато и да било мутация - изследването не е конкретно насочено само за английския вариант.
За отделния пациент едва ли е от значение дали е заразѐн с нов вариант на SARS-CoV-2, доколкото мутацията не води до по-тежко протичане на заболяването. То зависи основно от здравословното състояние на всеки отделен човек. Но заради убеждението, че промененият коронавирус се предава по-лесно от човек на друг, за здравните власти е важно да знаят до каква степен в страната се разпространява по-зара̀зен вариант. От това зависи дали и колко бързо ще бъде отново претоварена болничната система.
Как (не) се въвеждат ограничения срещу разпространението на коронавируса по области - тук
За обещанието на премиера ресторантите да отворят на 1 март - тук
Vlado Nikolov
Рейтинг: 3409 НеутралноАми сега? Бойко и щабът ще се оправдават ли и с английския щам, дето не върви работата? Или ще чакат и южноафриканския?
plamen_b
Рейтинг: 1684 ЛюбопитноДа не се окаже, че британският вариант е тръгнал от България?
bxr35608444
Рейтинг: 942 НеутралноВ Русия е създадена и регистрирана първата тест система за откриване на Британския щам на Корона Вируса :
https://youtu.be/Nw8ZrluQEBg
Ан Он
Рейтинг: 3148 Неутрално> Британският вариант на коронавируса е из цяла България
કટાક્ષУжас и паника, всички маймунки хукват да се катерят пак по дърветата.
> как се откриват мутациите
А кому е нужно ? Преди две години на някой пукаше ли му каква точно мутация на сезонния грип има надмощие в неговия регион?
****
Коментарът беше изтрит от модераторите, защото съдържаше обидни или нецензурни квалификации, обиди на расова, сексуална, етническа или верска основа или призиви към насилие по адрес на конкретни лица.
****
Коментарът беше изтрит от модераторите, защото съдържаше обидни или нецензурни квалификации, обиди на расова, сексуална, етническа или верска основа или призиви към насилие по адрес на конкретни лица.
Ан Он
Рейтинг: 3148 НеутралноДо коментар [#5] от "Северозападнал":
કટાક્ષИ да му се сложи ушна марка.
Ан Он
Рейтинг: 3148 НеутралноДо коментар [#1] от "Vlado Nikolov":
કટાક્ષ> дето не върви работата
Че коя работа не върви ? Ей на - вече навлизаме в Четвърта Фаза на Плана за Ваксинация.
Николай Бучков
Рейтинг: 4645 ЛюбопитноКак да открием , колко са прекарали и не са забелязали , защо и т.нат. което според мен става все по-наложително , докато повсеместно има хаос.......( с някое тук-там изключение....).
Ан Он
Рейтинг: 3148 НеутралноДо коментар [#1] от "Vlado Nikolov":
કટાક્ષФаза 1 - Очакван брой подлежащи: 243 600 лица
Фаза 2 - Очакван брой подлежащи: 112 080 лица
Фаза 3 - Очакван брой подлежащи: по предварително изготвени списъци.
Фаза 4 - Очакван брой подлежащи: 1 800 000
Добре че част от населението не иска да се ваксинира, иначе нямаше да сме преполовили още Фаза 1. Пък сега вече сме на Фаза 4.
Nik Nikolov
Рейтинг: 468 НеутралноТрябва с анален тест да започнат да работят нашите специлисти, бъркалес в дупарата и рязко ще секнат търчащите по болници с хрипащ глас и мърсоли в нослето...
Ан Он
Рейтинг: 3148 НеутралноДо коментар [#11] от "Nik Nikolov":
કટાક્ષАко тестовете са безплатни, може да възникне опасност от привикване към тестовия процес ?
historama
Рейтинг: 3723 НеутралноДокторите от НОЩ успяха да съсипят авторитета на една уважавана от векове професия!
ivanpopov
Рейтинг: 2384 НеутралноПоглеждат вирус през електронния микроскоп, докато го питат "Do you speak еnglish?" и ако отговори "Yea, I do, sir." значи е английския вариант. Ако отговори "Jo, mutafuka!" и ти извади пищов, за да те обере, най-вероятно е от южното полукълбо.
ivanpopov
Рейтинг: 2384 НеутралноДо коментар [#11] от "Nik Nikolov":
Само проктолозите още не бяха набутали в схемата. Че от как ставните хирурзи ги преквалифицираха на вирусолози, работата още не се е разкапала окончателно.
lil_alex
Рейтинг: 784 НеутралноКъдето и да погледнеш картинката, дори с много тестване т. нар. случаи намаляват, дори във Великобритания. Миналата година ни увещаваха как вирусът е стабилен и не мутира. Таман мина вълната и вече от чудене как да не отворят - о, нов щам по-опасен.
Не я ли изправихме тая крива, 2 седмици уж трябваше и вирусът щеше да отмине.
И кой по дяволите ходи да се тества, това са някакви параноици. Женичките си умират да тестват.
ve4e
Рейтинг: 82 НеутралноТрябва ли да ме интересува този факт. Каква полза носи тази информация. Може ли да ми повиши информираността с положителни последици. Това е факт, който никой не обслужва. Нито мога да го спра, нито да помогна.
Не ме интересувааааа вече. Вредата от всичко това е факт. Отношенията в обществото са дълбоко разпаднати. Дори в малките колективи.
Имам колега, който още като влезе в офиса започва да пръска с дезинфектант да ме гледа враждебно защото не съм с маска и т.н. ами не съм ок.
Разидинени и мразещи се. Затворени и изолирани. Страхуващи се и тревожни. Изнервени и озлобени. Разпад на ценности и омаловажаване на всичко останало. Всичко истински важно за един човек вече не е важно. Образование ,спорт , интереси , приятелство , отдих и др. Всички взети заедно правят човека човек - разумен стабилен психически , уверен, удовлетворен, физически активен и здрав.
В
Vlado Nikolov
Рейтинг: 3409 ВеселоДо коментар [#8] от "Ан Он":
Да бе! Как съм го пропущил?
Ганьо Калпакчиев
Рейтинг: 0 НеутралноБританският вирус е гадна работа.
petrapetra
Рейтинг: 973 НеутралноНа фона на циркулиращ по-заразен щам на ковид, адекватните мерки на правителството на ГЕРБ включват отваряне на ресторанти и барове. Борисов наистина вече не е престъпно безотговорен от малоумие, а провежда активна политика на геноцид.
subsonic
Рейтинг: 606 ВеселоДо коментар [#2] от "plamen_b":
Предлагам да го прекръстим на "Кюстендилски" вариант
Darkman
Рейтинг: 1298 Неутрално96 проби взети по различно време от десетки хиляди тестове няма как да са представителна извадка. Дори "математиците" от щаба го знаят. Око тестовете са взети от някой клъстър като Кюстендил нормално е да има такава бройка. Ако вземат 96 теста от Айтос може и нито 1 британски щам да не открият.
Фобиите и филиите са признак на ниско самочувствие и слугинажBilly Pilgrim
Рейтинг: 2076 НеутралноНе че им вярвам на данните но ако британския вариант върлува това е добре. Ако е по заразен (и това не е сигурно) значи по бързо кашлицата ще мине през всички и всеки ще си е изградил естествения имунитет както си му е редут и каквото са природните закони. Ако нямахме никакви мерки и ограничения досега това да де е случило и щяхме да сме забравили и за тази кашлица както за много други. Но този вариант явно не е удобен за управляващите по света с ние слушаме.
Patsis
Рейтинг: 4223 НеутралноДо коментар [#16] от "lil_alex":
Ами май я изправиха кривата:
През последните дни кривата на увеличаването на броя на откритите новозаразени изглежда се пречупи. Средно на ден:
15-21.1. - 416 /минимум/
16-22.1 - 418
17-23.1. - 423
18-24.1. - 429
19-25.1. - 458
20-26.1. - 498
21-27.1. - 515
22-28.1.-530
23-29.1. - 548
24-30.1. - 560
25-31.1 -562
26.1-1.2.- 570
27.1 -2.2. – 590
28.1 – 3.2 – 607
29.1 – 4.2 – 654
30.1-5.2 – 684
31.1.-6.2 – 705
1-7.2 – 712
2-8.2 – 754
3-9.2 – 788
4-10.2 -815
5-11.2 – 842
6-12.2 – 850
7-13.2 – 852
8-14.2 – 849
9-15.2 - 843
Към края на седмицата ще се види дали това ще бъде трайно.
Billy Pilgrim
Рейтинг: 2076 НеутралноДо коментар [#20] от "petrapetra":
В коя държава измря населението от ковид че чакате геноцид от отваряне на заведения?
Patsis
Рейтинг: 4223 НеутралноДо коментар [#16] от "lil_alex":
И броят на починалите се стабилизира, а в последните дни тръгна и надолу. Среднодневно:
3-29.1. - 30 /минимум/
24-30.1. - 31
25-31.1 - 32
26.1-1.2.- 37
27.1. -2.2 -37
28.1 – 3.2 – 39
29.1 – 4.2 - 43
30.1 – 5.2 – 42
31.1.-6.2 – 40
1-7.2 – 41
2-8.2 – 40
3-9.2 – 43
4-10.2 -44
5-11.2 – 41
6-12.2 – 42
7-13.2 – 42
8-14.2 – 42
9-15.2 - 36
Patsis
Рейтинг: 4223 НеутралноДо коментар [#16] от "lil_alex":
Репродуктивното число на вируса в последните дни взе да намалява, но все още е повече от единица:
10-20.1 – 0,74
11-21.1 – 0,76
12-22.1 – 0,84
13-23.1 – 0,86
14-24.1 – 0,90
15-25.1 – 0,96
16-26.1 – 1,02
17-27.1 -1,04
18-28.1 -1,07
19-29.1 – 1,12
20-30.1 – 1,14
21-31.1 – 1,16
22.1-1.2 – 1,17
23.1-2.2 – 1,18
24.1-3.2 -1,19
25.1 – 4.2 – 1,19
26.1-5.2 – 1,17
27.1 – 6.2 – 1,17
28.1 -7.2 - 1,16
29.1-8.2 – 1,17
30.1 -9.2 – 1,19
31.1 – 10.2 – 1,20
1.2 – 11.2 – 1,22
2.2 – 12.2 – 1,20
3.2-13.2 – 1,18
4.2 – 14.2 – 1,14
5.2 – 15.2 – 1,11
dosetliv
Рейтинг: 1364 НеутралноНа нАуката.
Др Валенски обяви, че следващия сезон ваксините ше са бивалентни: хем за стария ковид, хем за новия. Който си е бил ваксина само за стария ше ходи да му бият бустър. Понеже новите ваксини ше са бивалентни, а новите ковиди - много , треба първо тест да се види какъв вариант ваксина да ти изберат.
https://www.cbsnews.com/news/rochelle-walensky-cdc-director-uk-strain-coronavirus-face-the-nation/
Какво ни учи др Фаучи? Който вече е напълно ваксиниран и изпитва желание да си види семейството без маска, треба да почака. Това може да стане само когато всички от семейството са напълно ваксинирани.
https://www.yahoo.com/news/safe-visit-grandparents-getting-covid-174636701.html
В Шотландия са избрали друг подход: ваксинираните пенции ше имат право да си видят семейството чак след 3 месеца
https://www.yahoo.com/news/vaccinated-pensioners-scotland-could-face-192759944.html
Туй е малко странно, щото след 3 месеца ваксината ше е вече изфирясала.
lil_alex
Рейтинг: 784 НеутралноДо коментар [#27] от "Patsis":
Това репродуктивно число подвежда. Мисли се за обществото като един граф, в който всеки е точка с еднаква тежест. Оттам идват и ония щурави математици по формула да предричат апокалипсис.
А истината е: през няколко дни някъде много бързо един човек заразява много, ама много над 1.11 човека средно. Болниците са идеален развъдник и правят свръхразпространение. В същото време повечето хора си ходят стерилни като лабораторни мишки, ама ги подозират, че са супер заразни.
Също така колкото и да е заразен един вирус, той трудно може да прескочи между различните социални балони и общности. И когато зарази над 70% в един балон, ще се самопотуши. Даже по-заразен щам може да изчезне по-бързо. Вместо да се върти 20 дни, ще се завърти за три дни и в дадения балон (офис, завод, клас, ромска махала) вече ще имат имунитет.
Броенето на всеки за заразен вектор с еднаква тежест е точно като статистическото "свинско със зеле".
Billy Pilgrim
Рейтинг: 2076 НеутралноДо коментар [#27] от "Patsis":
Що за психар трябва да си че да тролиш всеки ден без пропуск с тази общодостъпна и никому ненужна информация.
Go Go
Рейтинг: 1020 ВеселоДо коментар [#14] от "ivanpopov":
73! Go GoАми ако вирусът отговори - Дую, но плохо!, какви ще ги деламе?...
Тони КОСТОВ
Рейтинг: 1001 НеутралноНищо. Чакаме да отворят кръчмите на 01.03. Само още две седмици.
Николов
Рейтинг: 1225 НеутралноБританският вариант не е просто по-заразен, но и по-смъртоносен:
“If you give people a good enough ‘why’, they will always figure out the ‘how’.” – J. Belforthttps://www.theguardian.com/world/2021/jan/22/new-uk-covid-variant-may-be-more-deadly-says-boris-johnson
xm...
Рейтинг: 3509 НеутралноМи тогаз де са у нас мъртвите от него?
За да го намерят сега - значи е тук от преди това. Доста преди това, защото влизането в България си е задължително с PCR, т.е. за да "влезе" и вече да го "хванат" си требе поне два инкубационни периода.
Да не говорим за "дисперсията" му - ако е толкова по-заразен - защо липсват "огнища" и "клъстъри", тази хубава думичка от началото на данаданията преди година, която май забравиха щабарите ?
Ан Он
Рейтинг: 3148 НеутралноДо коментар [#33] от "Николов":
કટાક્ષ>Британският вариант не е просто по-заразен, но и по-смъртоносен
И цитираш мнението на виден епидемолог
> says Boris Johnson
който по стечение на обстоятелствата му се налага в момента да се справя с една друга каша дето забърка (БРЕКЗИТ) ?
Judjuk
Рейтинг: 3113 НеутралноВсички знаем, че английския щам Боко го докара със самолет от Англия.
Bond007
Рейтинг: 653 ВеселоДо коментар [#23] от "Billy Pilgrim":
Колега, недейте да плашите и без това психясалите хипихондрици, че Кашлицата трябва да мине през всички, за да има имунитет. Тъкмо им се появи надежда, че с Ваксините ще се приключи този ужас, а то се оказа, че Ваксини нЕма.
petrapetra
Рейтинг: 973 НеутралноДо коментар [#25] от "Billy Pilgrim":
В коя държава разхлабват мерките при аналогична на нашата ситуация? А при нас статистиката сочи най-висока пряка и косвена смъртност, само смъртността от катастрофи е паднала!
Ан Он
Рейтинг: 3148 НеутралноДо коментар [#38] от "petrapetra":
કટાક્ષМалка корекция, пише се Мерките.
С главно М. С уважение.
MPetr
Рейтинг: 2690 НеутралноТе да кажат на колко места в България може да се направи това целогеномно секвениране....... Да разберат хората колко сме зле технологично и кадрово ......и не растително а човешко ? ...... гола вода сме, по зле сме целокупно от една болница в Истанбул даже.....
k_
Рейтинг: 2915 НеутралноДо коментар [#35] от "Ан Он":
А Бо Джо пък е цитиран от Гардиън, флагманът на глобалните алармисти в момента.
"Алармисти" са тия дето викат в пълен киносалон Пожар и пребъркват джобовете на публиката в тарапаната.
Nik Nikolov
Рейтинг: 468 НеутралноПо последни данни, британския щам предпочитал българските ковидиоти, така им налитал още от стратосферата си ги набелязавл и затова бил по, най- яко заразен, щото и рецепиентите много дашни били и ларж и станала симбиозата.
bretschneider
Рейтинг: 834 НеутралноЕми значи всичко е точно. Значи да отворим заведенията, нощните клубове, да разкараме мерките. Нали е по-заразен, да го пуснем да върлува 1 човек да заразява 10 и да се приключва до мсец цялата истерия, ще постигнем 70-80% имунитет, нищо че ще си заминат без време 50 000 човека, но така всички ще са доволни. Бизнеса ще е натрупал некой лев, медиците няма да им е скучно. Такива работи!
k_
Рейтинг: 2915 НеутралноДо коментар [#43] от "bretschneider":
Голем се майстор на ангро!
50000 без време!
Що не каза 500 000?
По-страшно Бау щеше да звучи.
Billy Pilgrim
Рейтинг: 2076 НеутралноДо коментар [#38] от "petrapetra":
Какво ни е на ситуацията? Още преди една година вирусолозите ви казаха че както всеки друг подобен и тоя вирус няма да го уплашиш с мерки и криене по домовете. Видно е че държави с доста по-строги мерки от нас като Англия, Германия, Испания и т.н. имат много повече заразени. От друга страна така и не разбрахме в Беларус хората да са измрели въпреки че цяло лято протестираха десетки хиляди накуп а мерки нямат абсолютно никакви. В скандинавските държави където пък мерките са супер мижави нещата са много по-добре отколкото в споменатите вече от мен държави в западна Европа. С мерки, без мерки, едно и също е за вируса, за икономиката и доходите на хората, както и за психичното здраве пък и за останалото което се влошава в резултат на паниката обаче нещата не са същите. Мерките съсипаха всичко, като се почне от доходи, през психиката на хората, и се стигне и до чисто здравословните проблеми породени от стреса и отслабения имунитет. А че в България принципно има супер кекаво "здравеопазване" това не е новост, така е от поне 20 години.
Ан Он
Рейтинг: 3148 НеутралноДо коментар [#45] от "Billy Pilgrim":
કટાક્ષ> Мерките съсипаха всичко,
Всъщност не всичко. Некои лица бая улов понатрупаха в мътната вода и хич не им се иска истерията да приключи.
****
Коментарът беше изтрит от модераторите, защото съдържаше рекламни съобщения или спам.
piliferus
Рейтинг: 413 НеутралноЦелогеномното изследване на вирус, който има само 30 000 нуклеотида геном, не е нито сложно, нито трудно, когато се прави в лаборатории, които си знаят работата. Не знам защо изобщо се мъчат да го правят в България, където е, първо, по-скъпо заради малкия обем, и второ, ненадеждно по същата причина. Да, в България е и сложно, и трудно. Ако изпращат пробите си във водещи европейски, американски, южнокорейски, или японски лаборатории, че даже и в китайски, ще получават резултатите си наготово, по-евтино, и за по-кратко време.
piliferus
Рейтинг: 413 НеутралноДо коментар [#36] от "Judjuk":
Не ми е известно Боко да е ходил до Великобритания. Знаем, че три папи са го галИли по главата, но не съм чувал Британската кралица да го е праснала с меч по тиквата.
Judjuk
Рейтинг: 3113 НеутралноПрати самолет да докарат берачите. Докараха ги.
historama
Рейтинг: 3723 НеутралноОсобено Мутафа и Кунчев